國家衛生計生委衛生發展研究中心的前身是衛生部衛生經濟研究所，于1991年經國家編委批準成立，是隸屬于中華人民共和國國家衛生和計劃生育委員會的國家級研究機構，是國家衛生計生委的技術咨詢和智囊機構。為更好的適應衛生改革與發展形勢的需要，進一步加強衛生政策研究。2010年經中央編辦批準，正式更名為衛生部衛生發展研究中心，2014年更名為國家衛生計生委衛生發展研究中心。

開展國家衛生改革與發展戰略研究，參與衛生改革發展實踐工作；
開展與國民健康相關的公共衛生政策研究，為國家制定衛生政策提供咨詢與建議；
開展衛生管理領域的研究與實踐；
開展衛生政策與技術評估的研究與實踐工作；
衛生經濟與衛生管理基礎理論與方法學研究及其實踐工作。

中心現設有15個研究室，3個行政管理處室，4個附設機構 及1個博士后科研工作站

新型農村合作醫療研究中心
　　在國家衛生計生委基層衛生司和財務司的領導下，承擔全國新農合的監督、檢查和評估，業務指導與培訓，信息管理與信息化建設，咨詢、投訴與稽查，開展調查和理論研究、總結推廣經驗，以及科研、國際交流與合作等項職責。
　　中國衛生經濟培訓與研究網絡執委會
　　中國衛生經濟培訓與研究網絡1991年由衛生部和世界銀行經濟發展學院合作成立。網絡成員單位25個，觀察員單位6個，他們分布在中國13個省份。“網絡”成員單位包括：國家衛生計生委衛生發展研究中心、北京醫科大學、上海醫科大學、華西醫科大學、同濟醫科大學、哈爾濱醫科大學、西安醫科大學、山東醫科大學、湖南醫科大學、大連醫科大學、中國衛生經濟雜志社和北京中醫藥大學等?！熬W絡”的主要功能有：培訓中國各級政府的衛生管理官員；培訓中國衛生經濟學與衛生管理學師資；研究衛生經濟與管理政策，提供決策建議和開展衛生經濟與管理的咨詢服務。
　　中國衛生經濟學會秘書處
　　中國衛生經濟學會是1983年經民政部批準成立的全國性學術團體。在全國31個省、自治區、直轄市的衛生經濟學會是本學會的團體會員。學會下設8個分支機構，現有會員4000余人。學會下設8各分支機構，現有會員4000余人。學會主辦期刊有：《中國衛生經濟》、《國外醫學衛生經濟分冊》、《中國衛生資源》及《中國衛生軟科學》。2009年學會成功舉辦第七屆國際衛生經濟大會（iHEA）。
　　中國衛生發展論壇
　　中國衛生發展論壇由國家衛生計生委衛生發展研究中心和英國發展研究所（IDS, UK）聯合建立，旨在協助決策者、研究者和衛生管理者開展溝通和交流活動。該論壇根據需要舉辦國際研討會、短期培訓、咨詢性培訓及其他小規模活動。通過這些會議和活動，研究者和決策者可以探討衛生問題并提出政策建議   。